MAN 2 Banyumas secara geografis terletak di Jalan Jenderal Sudirman No.
791 Purwokerto Kode Pos 53111. Berdiri di atas lahan bersertifikat tanah Hak Pakai No. 7 Tahun 1979 berdasarkan Surat Ukur No. 274 tanggal 13 Mei 1976 seluas 38.360 m2 atau 3,8360 Ha dengan perubahan nama berdasarkan Peraturan Pemerintah RI Cq. Kementerian Agama RI bersama Menteri Keuangan dan Kepala Badan Pertanahan Nasional RI tanggal 18 November 2013.
Sejak tahun 1950 bentuk awal MAN 2 Banyumas adalah Sekolah Guru
Agama Islam (SGAI) di Purbalingga . SGAI berdiri berdasarkan Surat Edaran Menteri Agama RI No. 2771/07/1950 tertanggal 15 Agustus 1950, di mana merupakan cikal bakal berdirinya Pendidikan Agama Negeri (PGAN)
Purwokerto. Kemudian berubah menjadi Madrasah Aliyah Negeri (MAN)
Purwokerto 2 berdasarkan Surat Keputusan Menteri Agama RI No. 42 Tahun 1992 tentang Pendidikan Guru Agama Negeri (PGAN) menjadi Madrasah Aliyah Negeri (MAN) tertanggal 27 Januari 1992, yang berlaku mulai tanggal 1 Juli 1992.
Berdasarkan Surat Keputusan Direktur Jenderal Pendidikan Islam No.4924
Tahun 2016 tertanggal 2 September 2016 yang menyatakan bahwa MAN
Purwokerto 2 adalah Madrasah Aliyah Penyelenggara Keterampilan. Kemudian berdasarkan Keputusan Menteri Agama RI No.810 Tahun 2017 MAN Purwokerto 2 resmi menjadi MAN 2 Banyumas hingga sekarang.
